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    5hmC或成为2型糖尿病(bìng)血(xuè)管并发症临床监控的(de)重(chóng)要标志物(wù)

    source:TIME:2019-10-01 08:00:00分(fèn)享(xiǎng)到(dào):

    2019年10月1日(rì),5-羟甲基化胞嘧(mì)啶(5-hydroxymethylcytosine,5hmC)在糖尿病(bìng)研究(jiū)领(lǐng)域取得重(chóng)要进展。2型糖尿(niào)病(bìng)(T2D)的血管(guǎn)并发症是导致2型糖尿病致残致死的重(chóng)要病因,一直缺乏(fá)一种无创便捷的(de)临床途径实(shí)现血管(guǎn)并发症的发生发展(zhǎn)监测,达(dá)到早发现、早干预(yù),以提高(gāo)T2D病人的整体生活(huó)质(zhì)量,减少卫生经济负(fù)担(dān)。


    该研究入组了(le)62例2型糖尿病病人,采用5hmC-Seal技术对血浆cfDNA中表观(guān)遗传标志物5hmC的分(fèn)布情况进行检测,分析5hmC标志物与2型糖尿病血管并发症发生发展的相关(guān)性。结果表明5hmC标(biāo)志物的变化(huà)与T2D合并大血管/微血管事件具有相关性,主要涉及一些(xiē)与血管(guǎn)生物学和糖尿病(bìng)(包括胰岛素耐受和炎症反应(yīng))相关的基(jī)因和信号通路。该研究建立的16个基因(yīn)-5hmC标志物组(zǔ)合(hé)检(jiǎn)测可以准确区分(fèn)有并发症和无(wú)并发症的2型糖尿病病人[实验组(zǔ):AUC=0.85;95% CI,0.73-0.96],明显优于传统临床变量例如白蛋白尿。除此之(zhī)外,还建立了13个基因-5hmC标志物组(zǔ)合检测(cè),可以(yǐ)进一(yī)步区分(fèn)T2D合并(bìng)单一并(bìng)发(fā)症和多种并(bìng)发症[实(shí)验组:AUC=0.84;95% CI,0.68-0.99],同样明显(xiǎn)优于其他传(chuán)统临(lín)床变量。该研究得出结论,5hmC标(biāo)志物反映(yìng)了(le)T2D病人(rén)大(dà)血管/微血(xuè)管并发症发生过程中的表(biǎo)观遗(yí)传变化,因而5hmC-Seal检测技术在(zài)监测糖尿病血管并发症发生和进(jìn)展(zhǎn)方面具有良好(hǎo)的临床应(yīng)用前景。


    试验设计



    本研究共(gòng)纳入62例2型糖尿病病人(rén),包括没有血管并发症的病人12例,有单一血管并发症(zhèng)的病(bìng)人34例(24例(lì)发生(shēng)大血管事件(jiàn),10例发生(shēng)微血管事件),以及有(yǒu)多种血管并发症的病人16例。试(shì)验收集(jí)62例病人血浆,提取(qǔ)cfDNA,利用5hmC-Seal技术捕获外周血cfDNA中的5hmC序列,进行(háng)二代测序,通(tōng)过生(shēng)物信息学分析找出(chū)并发症组与无并发症(zhèng)组之间有显(xiǎn)著5hmC修(xiū)饰差异的基因,单一并发症组(zǔ)和多种并发症组之间(jiān)有显著5hmC修饰差异(yì)的(de)基因。随后利用回(huí)归模型对(duì)差异基因进(jìn)一步筛选、优化,弹性网络进一(yī)步筛选,计算加权平均分,最后得到一组具有高度灵敏度和特异(yì)性的5hmC生物标(biāo)记物(wù),并进一步在实验组中(zhōng)验证,分析其灵敏度和特(tè)异性。并将(jiāng)新建(jiàn)立的5hmC标志物基因组(zǔ)合的检测性(xìng)能(néng)与(yǔ)传统临(lín)床变量进(jìn)行对比分析。最后对相关基因进行了信号(hào)通(tōng)路分析和(hé)功能(néng)探究。



    研究结果


    5hmC修饰水平(píng)与血管并(bìng)发症具(jù)有相(xiàng)关性


    利用逻(luó)辑回归模型对62例有(yǒu)并发症和无并发症(zhèng)2型糖尿病病人(rén)的5hmC差异水(shuǐ)平进行分析发现,有并发症2型糖尿病病人的622个差(chà)异修饰候选基(jī)因(包括上调和下调基因)的归一(yī)化平均数要明显高于无并发症的病人(P<0.001),但是单一并发症(zhèng)和多发并发症(zhèng)病人之间没有显著差异。

    之后(hòu)将有单一(yī)并发症或多种并发症的50例病人用逻辑回归模型进行了(le)对比,发现多种并(bìng)发症(zhèng)的病人的153个差异修饰候选(xuǎn)基因(包括上调和下调基因)的归(guī)一化(huà)平均数要低于无并发症病人(P<0.001)。


    5hmC标志物可区分有(yǒu)无(wú)并发症患(huàn)者


    62例2型糖尿病病人被随机分成(chéng)训(xùn)练组(n=31)和(hé)测试组(n=31)。利(lì)用弹性网络筛选后发现,16基因-5hmC标志物组(zǔ)合检测可以用于区分有并发症(zhèng)和无并发症的2型糖尿病病人。


    基于16基因(yīn)组合模型 (Detection Model 1) 的加权平均分分析,发现(xiàn)无并发症病(bìng)人的分数在训(xùn)练集和测(cè)试集(jí)中都明显低于有并(bìng)发症的病人(rén)。只考虑(lǜ)加权平均分的话,受试(shì)者工作(zuò)特征曲线(ROC)分析表明将cutoff值设置成(chéng)0.5时,在测试组(zǔ)中中的灵敏度为60%,特异性为100%。



    5hmC标志(zhì)物可区分病人是单一并(bìng)发症还(hái)是多种并(bìng)发症


    50例有并(bìng)发症的2型糖尿(niào)病病人被(bèi)随(suí)机(jī)分成训练组(n=25)和测试(shì)组(n=25)。利用弹性(xìng)网络筛选后(hòu)发现(xiàn),13基因-5hmC标志物(wù)组合可以区分(fèn)2型(xíng)糖尿病病人是否发生单(dān)一并发症(zhèng)或多种并发症。


    基于13基因组合(hé)模型 (Detection Model 2), 我们计算了单(dān)一并发(fā)症(zhèng)和多种(zhǒng)并(bìng)发症的加权平均分,发现在训(xùn)练(liàn)集和测试集中单(dān)一并发症(zhèng)和(hé)多种并发(fā)症(zhèng)病人的分数都有明显(xiǎn)差异。值得一提的是,有(yǒu)肾(shèn)病并发症和无(wú)肾(shèn)病并发(fā)症病人的分数(shù)也(yě)有明(míng)显差异(yì)。利用加权平均分作为判(pàn)断标准的受(shòu)试者工作(zuò)特征曲线(ROC)表明,在测试组中当将cutoff值设成0.69时,灵(líng)敏度(dù)为87.5%,特异性为68.8%。



    5hmC标志物与传统临床变量/危险(xiǎn)因子的对(duì)比(bǐ)


    我们评估了不同临床变量/危险因子用于监测血管并发症的(de)灵敏度和特异(yì)性(xìng)(见表1)。

    总体来说,结果(guǒ)表明一些临床(chuáng)变量(如尿液(yè)白蛋白(bái)、血清(qīng)ALT、AST、肌酐、GGT、脂蛋白a)虽然具有一(yī)定的灵敏度和特异性(xìng),但是整体准确度仍然差强人意,因此临床需要更加准确的方(fāng)法(fǎ)。另(lìng)外,我们还在训(xùn)练组(zǔ)中建立5hmC和不同(tóng)临床变量的多(duō)变量组合(hé)模型进(jìn)行评估(gū),该模型加权平均(jun1)分的(de)AUC要明显大(dà)于传统临(lín)床变量(liàng)的AUC。若将这些临床(chuáng)变(biàn)量与加权平均分(fèn)进(jìn)行结(jié)合,AUC也将进一步提高。因此,该多(duō)变(biàn)量模型表明加权平均分可作为一个独立的指标用于监测2型糖尿病血管并发症。

    信号通路分(fèn)析和功能探(tàn)究


    有并发症和无(wú)并发症(zhèng)病人的(de)135个差异候选基因的功(gōng)能注(zhù)释分析(xī)表(biǎo)明,这些基因主要富集(jí)在一些经典的信号(hào)通路。错误发现率相关P值位于前10%和基因数目≥3的(de)信(xìn)号通路包括由IGF1R, IL-10和FGFR2所介导的(de)信(xìn)号通路。由IGF1R和IL-10介导(dǎo)的信号(hào)通路与胰岛素抵抗及炎症(zhèng)反应相(xiàng)关(guān),在血管生物学和糖尿病发生发(fā)展过程(chéng)中发挥重要作用。

    Reactome相(xiàng)互作用(yòng)网络(luò)的(de)中心(xīn)表明,泛素(sù)编码基因[泛素(sù)B (UBB),泛素C (UBC),泛素A-52亚基(jī)核糖(táng)体(tǐ)蛋白融合产(chǎn)物1(UBA52)]是候选基因(如SMAD3FOXD2DRAP1MCIDASMLNPIANPTBCC)的重(chóng)要连接者(zhě)。在(zài)这135个差异(yì)候选基因中, 一些基因 (如(rú)TNFRSF25P=0.027, HR=6.25; MLNP=0.0021, HR=20.40; CCL3L1P=0.018, HR=0.44)表现出与糖尿病病程相关的倾向,表明5hmC和糖尿病血管并发症之间可能存在(zài)时间依赖性(xìng)的相互作(zuò)用。基于纵向时间队列(liè)的大(dà)样本研究,将可进一步明确5hmC变化和(hé)糖尿病持续时间之间(jiān)的动态(tài)关联(lián)。关于(yú)单一并发症和多种并(bìng)发症(zhèng)病(bìng)人的(de)159个(gè)候选标志基(jī)因的(de)功能注释(shì)研究发现,存在细胞-细胞连接、胶原(yuán)蛋白(bái)形成、新陈代谢、细胞应激应答信号通路(lù)的富(fù)集,这些(xiē)信号通路均与细胞(bāo)基本功能密(mì)切相(xiàng)关。


    研究意义(yì)



    血管并发症是三分之二糖尿病病人的死(sǐ)亡(wáng)原(yuán)因,若(ruò)能及早有效控制血管(guǎn)并(bìng)发症的发生(shēng),将极大地改(gǎi)善糖尿(niào)病病(bìng)人的生存质(zhì)量。该研(yán)究建(jiàn)立了(le)一种利用cfDNA进行2型糖尿病血管(guǎn)并发症监测的无(wú)创便捷(jié)方法,较目前临床(chuáng)标志(zhì)物(wù)能(néng)更准确地监控血管并发症的发生,从而(ér)提示临床及早采取应对措施(shī),有效控(kòng)制病情(qíng)进展(zhǎn)。



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